化工工程系位于阿拉善高新技术产业开发区乌斯太校区，是阿拉善职业技术学院重点建设系部之一。高职开设：应用化工技术、分析检验技术、化工安全技术；中职开设：化工工艺专业。化工工程系现有各级各类在校生23个教学班923人。建有校内实训室11个，校外生产性实训基地16个，与辖区内化工生产企业、药品生产企业建立了长期稳定的校企合作关系，满足学生实习、就业需求。

化工工程系现有教职工23人，其中处级正职2人，副处2人。专业技术岗位17人，具有副教授等高级专业技术职称6人。在岗教师中拥有研究生学历12人，研究生学位12人。专任教师中有自治区认定"双师型"教师11人，占65%。拥有"内蒙古自治区草原英才”1名，自治区级专业带头人1名。“工业分析检验”教学团队荣获自治区级优秀教学团队。近年来相继完成国家、自治区级、盟级、学院级多项科研项目，发表相关学术论文近100篇，获得国家实用新型发明专利多项。

近3年来，师生在各级各类职业技能大赛中荣获多项荣誉。2023年春季全区职业院校技能大赛化学实验技术赛项二等奖、2023年秋季全区职业院校技能大赛化学实验技术赛项二等奖、化工生产技术赛项三等奖；2024年全区职业院校技能大赛化学实验技术赛项一等奖1项、二等奖1项，化工生产技术赛项三等奖1项；2025年参加世界职业院校技能大赛化工技术赛道获铜奖；与兄弟院校联赛中斩获化学实验技术赛项一等奖1项、二等奖2项、三等奖2项；2025年一带一路暨金砖国家技能发展与技术创新大赛第二届食品药品质量安全与检测技术赛项全国选拔赛二等奖2项。2025年全区职业院校教师教学能力大赛一等奖1项。